io.github.rarasAI/raras

Tools

• analyze_clinical_case

  Caso clínico → doenças candidatas + literatura relevante em 1 chamada. Apenas informativo, nunca diagnóstico.

  shallow
• explain_relation

  Raciocínio fundamentado sobre o grafo: dada uma pergunta (ex.: "por que o gene X se associa à doença Y?", "como a droga Z se relaciona a esta doença?"), retorna caminhos de evidência multi-hop (doença↔gene↔via↔droga↔fenótipo) com proveniência citável. Se não houver caminho no grafo, recusa — nunca inventa.

  shallow
• find_active_trials

  Trials ativos com filtro Brazil.

  shallow
• find_diseases_by_phenotypes

  Match por IDs HPO. Use para diagnóstico diferencial.

  shallow
• find_papers_for_disease

  Literatura relacionada a uma doença via embeddings (:SEMANTIC_MATCH, fallback vetorial).

  shallow
• find_phenotypically_similar

  Doenças com perfil de fenótipos HPO semelhante (simGIC pré-computado, explicável: nº de fenótipos em comum). Complementa find_similar_diseases (semântico).

  shallow
• find_reference_centers

  Centros por doença e/ou UF, com CNES.

  shallow
• find_similar_diseases

  Vector similarity via embeddings SOTA.

  shallow
• get_disease_detail

  Fenótipos HPO, genes, SUS, trials, descrição clínica em PT.

  shallow
• get_evidence

  Cross-references de autoridade (Orphanet, MONDO, OMIM, MeSH, GARD, UMLS), status de verificação e PMIDs de uma doença. A base da regra "nunca inventar".

  shallow
• get_graph_stats

  Contagens e métricas do dataset.

  shallow
• get_hypotheses

  Candidatos a reposicionamento de fármacos gerados por associação de genes (guilt-by-association): drogas que tratam outras doenças que compartilham genes com esta. HIPÓTESES para investigação, NUNCA recomendações clínicas — cada uma rastreável (via gene X, da doença Y).

  shallow
• get_literature_relations

  Relações tipadas extraídas da literatura biomédica (associate/treat/cause/inhibit/stimulate/prevent) entre a doença e genes/fármacos, com nº de publicações como proveniência. Filtrável por predicado.

  shallow
• get_recent_updates

  Doenças cujo gêmeo digital ganhou evidência nova (autoria, PubTator3, Open Targets, verificação) nos últimos N dias. Faça polling para acompanhar mudanças (substituto stateless de subscriptions).

  shallow
• get_research_log

  Registro cronológico do que o agente autônomo fez por esta doença: autoria, mineração de literatura, evidência genética, verificação, prospecção de fontes, recomputação de relações. Prova de que o gêmeo digital estuda a doença continuamente.

  shallow
• get_schema

  Node labels, relationship types e property keys do grafo. Use antes de cypher_query.

  shallow
• get_sus_coverage

  CEAF, SIGTAP, PNTN, nível de integração.

  shallow
• search_diseases

  Full-text search em 10.468 doenças raras. Suporta filtros SUS/trials.

  shallow
• search_papers_semantic

  Busca vetorial sobre 424k papers do PubMed. Use caso clínico, pergunta ou conjunto de sintomas.

  shallow
• search_phenotypes

  Lookup HPO em PT ou EN. Retorna IDs HP:.

  shallow

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Tool count and median score across every tool in this server’s corpus — honest in a way a single cherry-picked tool’s badge wouldn’t be.

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